ポケモンファイアレッドでは、主人公がポケモンリーグを制覇し、最強のポケモントレーナーとなることができます。しかし、レッドが消えた世界の結末では、主人公がポケモンリーグに挑戦する前に突然レッドが姿を消してしまいました。そのため、主人公はレッドの代わりにポケモンリーグを制覇することになります。
レッドとの最後のバトルができなかった主人公は、ポケモンリーグのチャンピオンになることに成功しますが、その喜びは半ば希望の無いものとなります。レッドとの因縁の最終決戦は果たせず、ポケモンマスターとしての成長も、もはやレッドとの比較のためではなくなってしまったのです。
その後、主人公はレッドが消えた世界の謎を解き明かすため、あらゆる場所を探索し、ポケモンを育てていきます。そして、ついにレッドの居場所を突き止め、再び対面することができます。レッドは幻となって現れ、主人公にポケモンバトルを挑みます。
結末はともかく、主人公は自分の力がレッドと同じくらい強くなり、自信を持つことができたのです。レッドとのバトルの勝敗はそれほど重要ではなく、主人公自身の成長と、レッドとの友情の大切さが強調される結末となっています。
