初代ポケモンの青版限定要素は、以下の通りです。
1. ジャパンカップ開催：青版ではレッド版では手に入らない「ジャパンカップ」が開催されます。自分のポケモンが世界一を目指して戦うことができます。
2. 新たなトレーナー「グリーン」登場：青版では、新たなライバルとしてミドリ（グリーン）が登場します。レッドのライバルではなく、最終的には協力してジャパンカップに出場することになります。
3. 最終ボス「グリーン」のポケモンが変更：オーキド博士の孫であるグリーンのポケモンは、レッド版ではピカチュウだったのに対し、青版ではイーブイに変更されます。
4. 新たなポケモン「マダツボミ」の出現率が上昇：青版では、マダツボミの出現率がレッド版に比べて上がっています。レベルの低いポケモンながら、種族値が高く育てると強いポケモンに育つこともあるため、早めに手に入れることができるようになっています。
5. クビキラーとカサブランカの交換：青版では、クビキラーとカサブランカを交換することができます。それぞれのポケモンの種族値が逆になっているため、交換することで新たな育成パターンを楽しむことができます。
6. ポケモンの習得技が異なる：青版では、レッド版と異なる習得技を持つポケモンがいくつか存在します。例えば、ピカチュウはサンダーパンチを習得できますが、青版ではでんきショックを習得するようになっています。
7. プラスル・マイナンの入手方法が変更：レッド版ではイッシュ地方のポケモンとして登場するプラスル・マイナンですが、青版ではミズゴロウと共にスターターとして入手することができます。
8. ピクシーの変更：レッド版ではピクシーは一般的には瓶に入ったポケモンとして登場しますが、青版ではピクシーの入れ物はハート型のボトルに変更されています。
9. ポケモン図鑑の入手方法が異なる：青版ではレッド版と違い、ポケモン図鑑はゲームクリア後、オーキド博士から手に入れることができます。また、図鑑には複数のデータが収録されており、ミドリ（グリーン）やジャパンカップで使用したポケモンのデータも見ることができます。
