最終形態のポケモン、テラパゴスがついに登場しました！これまでゼロの秘宝を求めて冒険してきた主人公たちですが、前に進むためにはテラパゴスを倒す必要があります。しかし、そこにはまさかの展開が待ち受けていました。主人公の仲間であるスグリが、なんとテラパゴスに味方することを決意してしまったのです！
しかし、スグリには理由がありました。彼女は自分の家族のように大切にしていたポケモンがいることが発覚し、そのポケモンがテラパゴスの力を必要としていたのです。スグリは友情と家族愛からの行動だったのです。そんな感動的なシーンを経て、主人公たちはテラパゴスとの最終決戦に挑みます。
そして、ついにテラパゴスを倒し、ゼロの秘宝を手に入れた主人公たち。しかし、そこで果たして驚きの事実が明かされます。実は、ゼロの秘宝が持つ力によって世界が危険な状態に陥っていたのです。それを救うためには、主人公たちがゼロの秘宝を守り続ける必要があったのです。
最終形態テラパゴスを倒し、ゼロの秘宝の危険な力を封印することに成功した主人公たち。しかし、それはまだゲームの終わりではありません。今後も主人公たちは新たな冒険やトレーナーとの出会いを通して、ポケモンの世界を楽しんでいくのです。さあ、次の旅に出かけましょう！
