今回のエピソードでは、主人公がポケモンの世界で最高のボールである「マスターボール」を手に入れるための旅に挑戦します。そのためには、世界中に点在する「使用率圏外（しようりつけんがい）」と呼ばれるポケモンたちの捕獲率が非常に低い場所を巡る必要があります。主人公は自らの覚悟を決め、スタート地点であるカントー地方を出発します。
最初の目的地は「タイルーム」。この地域では、希少種の「ケンタロス」や「ミュウ」などが生息していますが、その捕獲率は通常よりもさらに低くなっています。しかし、主人公は手持ちのポケモンたちと協力しながら、タイルームを探索していきます。
次に向かったのは「キモリアル」。ここでは、主人公がまだ手に入れていないポケモン、「エーフィ」と「ブラッキー」を捕まえるために奮闘します。しかし、使用率圏外のポケモンたちはとても強く、なかなか捕まえることができません。
最終的にたどり着いたのは「ムウマスタジアム」。ここには、伝説のポケモン「ムウマージ」が出現します。主人公は緊張しながらも、手にした「マスターボール」でムウマージを捕獲することに成功します。そして、ついに主人公は「マスターボール級」の最高峰に達するのでした。
ポケモンの旅はまだまだ続きますが、主人公はこれからも新しいポケモンとの出会いや挑戦に向けて、さらなる冒険を続けていくのでした。
