20年以上前、ポケモンの世界でサトシとレッドは幼い頃から仲間同士であった。しかし、旅の途中に出会った相手として、二人の関係は激しく変化することになる。
最初はどちらが強いトレーナーか分からなかったが、サトシはピカチュウを持っていたことで人々から注目され、有名になっていった。一方、レッドはジムリーダーとして名を馳せ、世界最強のトレーナーとしての名声を得ていった。二人はそれぞれの道を歩んでいくうちに、お互いを尊敬し合うようになっていった。
しかし、20年経った今、二人の運命が逆転することになる。サトシはポケモンリーグのチャンピオンとして、世界中のトレーナーから尊敬を集めていた。一方、レッドは実は闇のトレーナーであり、世界中のポケモン達を支配しようと企んでいた。そしてレッドの野望を止めるため、サトシは彼と激しいバトルを繰り広げることになる。
二人の間には過去の友情があり、互いをよく知っている。しかし、今回のバトルでは友情など取るに足らず、互いに全力を出し尽くして戦い合うことになる。果たして、どちらが勝つのか。それはポケモンの世界のみならず、二人の運命をも変える大きな戦いとなるだろう。
