ポケポケとポケモンはともに日本のゲーム会社、任天堂が開発した人気ゲーム「ポケットモンスター」シリーズに登場するモンスターの総称です。ポケモンは「ポケットモンスター」の略称であり、ゲームやアニメ、トレーディングカードゲームなどで使用されています。
一方、ポケポケは「ポケットモンスター ポケットに入れる（ポケットモンスターを手のひらサイズに小さくする）」という意味の造語で、任天堂が登録した商標です。ポケポケ自体はゲームやアニメなどには登場せず、ポケモンとして認知されているキャラクターを指す場合もあります。
つまり、ポケモンは「ポケットモンスター」シリーズに登場する架空の生き物の総称であり、ポケポケは任天堂が作成した商標であり、特定のキャラクターを指していることが多いという違いがあります。
